企业的信用分类将直接影响企业的通关实效：认证企业享受海关通关便利措施，一般信用企业适用常规管理措施，失信企业将受到海关严密监管。此外，新办法还规定“认证企业是中国海关经认证的经营者（AEO）”。AEO制度是一项国际海关通行做法，通过我国与其他国家海关之间AEO互认协议，高级认证企业将不仅仅在中国地区便利通关，更可同时享受互认国家或地区海关的通关优惠措施。

（一）高级认证企业适用的通关便利措施

1.在确定进出口货物的商品归类、海关估价、原产地或者办结其他海关手续前先行办理验放手续；

2.海关为企业设立协调员；

3.对从事加工贸易的企业，不实行银行保证金台账制度；

4.AEO互认国家或者地区海关提供的通关便利措施。

（二）一般认证企业适用的通关便利措施

1.较低进出口货物查验率；

2.简化进出口货物单证审核；

3.优先办理进出口货物通关手续；

4.海关总署规定的其他管理原则和措施。

（三）失信企业适用的严格监管措施

1. 较高进出口货物查验率；

2.进出口货物单证重点审核；

3.加工贸易等环节实施重点监管；

4.海关总署规定的其他管理原则和措施。

（四）其他规定

1.因企业信用状况认定结果不一致导致适用的管理措施相抵触的，海关按照就低原则实施管理。如在一票进出口报关单，收发货人、报关企业信用等级不一致时，按照就低原则；

2.认证企业涉嫌走私被立案侦查或者调查的，海关暂停适用相应管理措施，按照一般信用企业进行管理。